跑焦是指镜头的自动对焦功能不准确，简单地说就是可能造成你的照片该清晰的地方不清晰。例如，本来你拍人像，对焦在眼睛上，机器也显示对焦完成，但实际拍出来的照片焦点不在眼睛上，可能在鼻子上，造成眼睛部分比较模糊。跑焦一般跟机身对焦精度以及镜头出厂调校有关，很多时候是因人而异的。
从上面的解释可以看出，跑焦跟因为摄影中机身晃动等等造成的照片模糊是两回事。例如在某种光线环境下，测光给出的快门速度是1/10s，这时候手持的话因为无法拿稳，照片不可避免会模糊，但是如果有防抖，则有可能拍清晰。
这也解释了你说的第二个问题，跑焦与否跟镜头是否有防抖功能无关。
防抖镜头可以保证你在较低快门下面拍出比较清晰的照片，不过是否跑焦还是要看运气。
