本来不想回答的，不过看到误人子弟的回答，实在是忍不住了。
首先我一个个纠正楼上朋友的错误：
第一、闪光灯问题
5D3跟 D800 这个水平的相机，就不应该配闪光灯！
你问问所有D800 D700的用户，骂的最多的一条就是“相机带一个根本用不上的垃圾内闪”
内置闪光灯的照明效果，对于用到这个等级相机的摄影师来说，简直就是噩梦。
5D3 没有闪光灯并不是缺点，而D800有内置闪光灯也不是优点，你问问身边搞摄影的朋友，谁在用D800，他肯定会告诉你“那垃圾灯，我从来没打开用过”。
第二、像素问题
D800像素高是人为后期刷高的，靠的是软件虚高，CMOS的成像能力与解像力指标并没有提升。而且像素被刷高直接影响到两个问题：1、图像处理器受拖累造成解像力下降；2、图像处理器受拖累造成连拍速度跟写入速度下降。
所以佳能顶级1DX像素只有1800W，而尼康顶级D4像素只有1600W。因为这个像素才是最理想的最平衡的。尼康现在一味提高像素只不过是“寻求卖点”而已。说白了就是哄骗新手。
5D3 跟5D2 几乎持平的 2200W像素要厚道一些，只不过厚道不讨好罢了。
第三、对焦点问题
5D3 是61点对焦，但是实际上可靠地十字对焦点只有41个，而且做不到电测联动，测光也是分区测光而已。
D800 51点对焦虽然总数看似少，但是有电测联动，而且测光系统是跟佳能1DX一样的RGB测光模式。
其实单独看这个性能，反而是D800要高出更多。
只不过对于专业摄影师来说，“测光”只是参考，更多的测光还是用自己的眼镜跟大脑来运算，不依赖相机，所以这个差距实际上并没多大。
而5D3对焦点的优势不再“虚报的点多”而在于对焦速度快，并且对焦点设置跟切换方式人性化，极大的提升了对焦过程的效率。
其他方面综合来说5D3 跟 D800 都是很好的机器。
但是在佳能圈子里普遍认为5D3是5D2的升级版，在需要提升的地方提升了（对焦点，对焦模式，视频拍摄过程的静音操作……等等）
但是尼康圈子里的老摄影师们却普遍认为D800没有D700好，因为D800的高像素给拍摄过程和后期修图还有存储过程带来了极大不便。而且快门的结构跟声音，也没有D700时候干脆。
到底选哪一个，我建议你从实际角度去考虑。
首先你先问问你身边所有玩儿单反的朋友，用什么品牌的多。
身边都是佳能党，你就买5D3 ，身边都是尼康用户，你就买D800.
镜头群这个东西一个人是不可能买全的，我们到现在也是每个人有5、6个头，然后彼此比较熟悉的摄影同好之间错开镜头群彼此互补。同门师兄弟多在玩儿摄影的过程中是有很多方便的。
同样的道理，如果你身边都是 索尼的单反用户，我也同样推荐你放弃佳能跟尼康，买一款索尼的全画幅单反。
只有跟身边人可以很流畅的沟通跟交流，拍摄过程才是最愉快，并且进步最迅速的，自己玩儿会很无趣，而且水平也不会有多大提高。
当然，如果你已经是大师了，没有任何需要咨询他人的问题，可以不考了我后面的这个建议
我是来顶Thorn69的啊。我真的不知道说闪光灯的那位朋友是自己不用这种机器呢，还是真的是钱多随便买了个其实不是很懂。用全副特别是5d3和d800这个档次的人，谁用内闪啊？？光那么硬。唉。。。其他不说了。不过我买了d600用了一段时间感觉不行换了5d3，感觉很好。d800没用过，我就不说啥了。
尼康D800早已退市了。尼康D810完胜5D3，5D4才能与D810匹敌。
这两款单反其实是一个档次、一个级别的机器，尼康的D800像素高，带内置闪光灯，而且支持USB3.0，佳能的5D3的对焦点数是61点（D800是51点），其他方面相对来说不如D800，就说闪光灯吧，佳能只要是全幅机都不带闪光灯，这点佳能太扣了，必须再另外购买闪光灯。总的来说，还得看你偏好于尼康还是佳能，任选一个都不会错，因为这两个家都是单反专业户，几乎各占一半，再说后期镜头、配件都还是比较全面的。希望你能找好“坑”跳进去。
这叫仁者见仁智者见智，永远说不明白，只有厂家和广告商才会大声吼叫。我使用D800半年，感觉还可以。
